今天台风不用脚本,如何轻松获取TCGA临床数据?-SCI狂人

不用脚本潮田玲子,如何轻松获取TCGA临床数据?-SCI狂人
之前,看见很多人在QQ群,或者一些论坛求助脚本来提取生存时间,有些人有了脚本,但是不知道提取那个文件了。因此,今天分享一下如何不用脚本就能轻松获取TCGA临床数据。
TCGA没有改版之前,生存时间等信息主要整合在metadata文件刳屋敷剑八,可是metadata是json文件今天台风,看上去完全是一堆乱码,不懂编程根本就无法获取相关的数据江塘集中营。

面对这种json文件特工教师 ,对于不会写脚本的人来说,的确很头疼,但是在2018年TCGA又进行了改版,TCGA将临床数据放在单独的文件,这种数据有两种格式,一种是TSV,一种是JSON。

有些人参加过TCGA的课程,课程教他们直接下载JSON文件樊哈儿,然后用Perl脚本提取生存时间,但是改版后,有人说这些脚本提取不了,会报错,但是自己又不懂编程信丰教育网,所以就到处求助。对于不会编程的朋友,我们应该选择下载TSV文件,这文件可以用EXCEL打开邻居网,然后轻松提取我们想要的数据,除了提取生存时间外,程丽莎我们还可以提取患者的性别拉夫德尔,人种,年龄,肿瘤分级扬华素质网。佘赛花。。等信息然后做后续的分析。



希望本文对大家有所帮助。
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